有愛在的地方，就是故鄉。

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水35l，碳20kg，氨4l，石灰1.5kg，磷800g，鹽250g，硝石100g，硫磺80g，氟7.5g，鐵5g，矽3g，負離子280g，其他少量的十五種元素。
——這就是一個成年人身體的構成成份。

那個被稱做「鋼」的少年鍊金術士，坐在教堂中，面對莊嚴肅穆的神像，以一副輕鬆的口吻說出這些話。由此，拉開了鍊金術世界的序幕。

愛德和阿爾，這對兄弟為了使他們早逝的母親復活，實施了鍊金術中最大的禁忌，人體煉成。
煉成的失敗，使得愛德失去了左腿，阿爾則失去了整個身體……為了喚回弟弟的靈魂，愛德犧牲了自己的右臂，把阿爾的靈魂附著在一副鎧甲上。
付出如此巨大的代價，這便是鍊金術中所謂的「等價交換」。
為了尋回失去的一切，他們踏上尋找擁有極大力量的賢者之石的旅程，這段日子裡，他們認識了很多人，也經歷了許多不該是他們那個年齡的孩子經歷的事情……

最後，為了拿回阿爾的身體，愛德自願留在了與那個世界平行的，另一邊的世界。而阿爾，則忘記了失去身體這段時間的記憶……

納粹統治下的德國，戰爭一觸即發。更有人覬覦愛德出生成長的世界，他們把它稱做「森巴拉」。
有尋找家園的人，有懼怕那裡的人，有嚮往力量的人……
形形色色的人，聚集在一起，試圖打開通往那個世界的大門。
當然，「門」並不是如此輕易就可以打開的，即使通過了那扇門，也不一定可以生存下來，更有可能的是成為屍體或是怪物。
於是，與愛德一起生活的酷似阿爾的少年機械師，他發明的火箭成為了他們要藉助的力量。

殺戮，犧牲……
「門」最終還是被打開了，一邊是渴望著新世界的人們，另一邊是要尋回哥哥的阿爾。
然而，可怕的事情也出現了，為首的領袖要的不是新世界，而是征服與毀滅。
愛德和阿爾，與他們曾經同生共死的朋友，極力守護這個世界。
戰爭終於結束，但愛德卻選擇回到另一邊的世界，關閉大門，永遠不再開啟。
阿爾也跟隨著他，一起離開了鍊金術的世界。
青梅竹馬的女孩望著他離去的背影，輕嘆了一口氣。
「看來他是不想我再繼續等待了……」

經過戰火多次洗禮的鍊金術之國，終於奢華謝幕。
人們會幸福的，生活下去。

在這邊的世界，墳墓前，身著白衣的吉卜塞女郎跳著安魂的舞蹈，裙裾飄揚，人們選擇更加堅強地生活。
雖然戰爭的陰影籠罩了整個世界，但愛德和阿爾決定為這裡的人們繼續努力。因為已經不能不去理會，這個有著和故鄉相同的，同樣充滿溫情的地方。

誰說你沒有故鄉？有愛在的地方，就是故鄉。
愛德，阿爾，一定要堅強的，活下去。

另外要說的是，羅伊，你戴著眼罩還是那麼帥。