幾點推測

1、因為很雜，所以很多地方都很不自恰，也很難真正地完全地解釋清楚，估計導演自己也講不清楚。例如Oracle說史密斯是Neo的Negative，這個是在何種意義上的？又是如何實現的？為什麼Neo在Zion和Matrix里都有超能力？等等等等。

2、本來第一部只是講一個虛擬世界的真實性問題，這個框很大也很鬆。不管是誰，都可以往裡面任意地塞自己的東西，所以大家很樂意用這個來闡釋自己的道道，到第二部，才是導演講述自己的理論和自己的設定的問題，一些很有趣很好玩的設定被提出來。可惜第三部里光注重打架的特效了，對問題的探討弱了很多，很有虎頭蛇尾的感覺。

3、實際上Matrix並不是完全模擬現實。完全模擬是肯定做不到的，即使完全模擬出一個人，也超乎Matrix的能力範圍。Matrix裡的類人程序僅僅是AI，不過很多似乎程序都偏乎了其最初設計的目的。實際上Architect雖然對大部份的因果性瞭如指掌，但他並不知道所有要發生的事情——因為這涉及到人，而Architect對人的理解很糟糕，雖然他大部份時間都很自負，不停地說你們人類如何如何地Predictable。如果他真的完全理解人類行為的話，他第一次設計就把Matrix給設計好了。

4、Merovingian反覆地談必然性和因果性，但實際上它對人類的理解比Architect還要差，他對因果性的理解僅僅建立在Power的基礎之上，有能力的人/程序可以讓無能力的人看起來無可選擇，但並不總是如此。就好像現在電腦裡的偽隨機一樣，Matrix裡的因果也是偽因果。所以當Trinity舉槍指著他的頭的時候，他既不是震驚也不是恐懼，而只是說，你們人類的行為總是那麼的insane。可見這傢伙僅僅考慮到理性選擇，還是挺sb的。

5、Oracle也反覆地談必然性，不停地跟Neo說，你必然會如何如何，只是你不知道為什麼如何如何。不過這傢伙實際上很喜歡裝神弄鬼，她對必然性的解釋很大程度上來自於神棍作風。為什麼這麼說？因為她是研究人類心理的，對人類心理有了解相當精闢，所以在很多時候即使涉及到人的因素，她也可以做出正確的判斷。例如她第一次見到Neo的時候，她知道Neo要碰碎花瓶。這個是典型的算命先生的作風。

6、Zion是真實的嗎？如果Zion不是真實的話，那麼可以說整個故事都僅僅是主機裡的程序運算了，包括，那就是說，所有的故事，都不過依然是個大的Matrix——華麗世界的Matrix和骯髒世界的Matrix的合集——依然是個Matrix，這和Architect的話矛盾。除非，Architect以外還有設計者，設計了Zion，不過這樣層層上推，就比較無聊了。