揭開塵封多年的911真相

故事開場於2001年9月10日上午，超人一登場就在紐約布魯克林大橋遭遇金屬人，雙方一通激戰後，金屬人被打落水底，但超人也被金屬人體內的氪石照射，實力大減。聞訊趕到的蝙蝠俠見超人懸吊在高空，以為他在賣萌，後來才發現他暫時失去了超能力。

此時，一名叫貝恩的恐怖份子突然發難，脅迫了一群通緝犯，包括小丑，企鵝，謎語人等，逼迫他們先在電視上做脫口秀，然後前往紐約市各地引爆炸彈。一時間，大橋、地鐵接連爆破，連正義聯盟總部也被炸，但綠燈俠、神奇女俠等關鍵成員活了下來，並從電腦中尋找線索。

超人搭乘蝙蝠車追趕最後一名恐怖份子，途中蝙蝠俠驚訝地發現，此人竟是雙面人。他一直以為雙面人在刺殺戈登局長當晚已死，誰知竟被超人救走，並改邪歸正，和毒藤女隱居多年。

追逐中，雙面人辯稱貝恩綁架了毒藤女，脅迫他重出江湖。蝙蝠俠要將之轟殺，但在超人阻撓下，雙方撞車後生還，總算說明了原委。隨後他們遭遇了運送EMP火箭的韋恩企業車隊，由於韋恩的大意，他的公司前不久已被暗殺聯盟控制。

很快，機械戰警開路的恐怖份子殺到，殺光車隊警衛，搶走了火箭。有著低沉嗓音的貝恩現身了，並觸發了雙面人身上的炸彈。超人本能地用身體去擋，才想起超能力已失，還好他高中曾是橄欖球校隊主力，一個投擲將炸彈扔出了危險區。

根據雙面人留下的地址，超人和蝙蝠俠找到紐約市郊區的一棟建築。他們遭遇了秘密潛入的特種部隊，由美國隊長帶領。雖然雙方利益一致，但由於DC和漫威爭奪市場十分激烈，超人和隊長還是走了一趟不打不相識的過場，好向兩邊的CEO交代。

美國隊長的手下包圍了敵人，不料他們踏進了圈套，遭到埋伏在此的貝恩軍團的襲擊。為首的是被貝恩洗腦後的冬兵，將措手不及的美國隊長被打傷。失去超能力的超人和機械戰警一番纏鬥，將其摧毀，已是筋疲力盡，和蝙蝠俠一起被冬兵俘虜。

超人和蝙蝠俠見到了貝恩，貝恩用充滿磁性的嗓音發表了一番演講，大意不外乎：貝恩大法好，信貝恩得永生之類。超人嗤之以鼻。貝恩猙獰一笑，話鋒一轉：「肯特先生，這麼多年來，你為了捍衛地球的安全，一次次罔顧自己的生命，為了讓你意識到生命的可貴，我想跟你玩個遊戲，這裡有個開關，只要按下，就能阻止火箭發射，但會殺死所有人質，你只有5分鐘時間，是生，還是死，選擇在你。」

超人哭笑不得：你丫的電鋸驚魂看多了，玩什麼變態遊戲！話雖如此，他還是和蝙蝠俠不顧一切衝向樓頂，但失去了飛行能力的他，終於沒來得及阻止火箭發射。頓時紐約陷入一片混亂，橄欖球場塌陷，飛機噌噌往下掉，警察都被封進了下水道里，貝恩成功發動起廣大勞動人民佔領城市，審判富人，紐約洋溢在一片喜氣洋洋中。

EMP摧毀了所有電子設備，但蝙蝠俠嘿嘿一笑，還好我早有準備。他們從韋恩集團捐贈的博物館裡取到備用套件，追蹤到貝恩的第二處基地。搭檔倆先後擊敗猿人科巴、大鋼牙、女拳霸等狠角色，終於找到毒藤女，並發現貝恩已經和安布雷拉（俗稱雨傘）公司合謀，要將一種病毒擴散到全城，毒藤女的身體是最好的培育載體。這項代號惡靈古堡的陰謀一旦得逞，紐約會變為一座喪屍城。

與此同時，神奇女俠循著綠燈俠找出的線索，抵達了貝恩設在貧民窟的基地，也得知了貝恩為何要玩豎鋸遊戲的原因：原來他就是已故的豎鋸的兒子，豎鋸曾為神盾局秘密工作，過後卻被滅口，對當局失望的貝恩轉而策劃復仇大計。

循著這條資訊，超人與蝙蝠俠終於定位貝恩的老巢——世貿雙塔的頂樓。超人與恭候多時的貝恩展開了肉搏，貝恩用一招斷背將超人摔翻，但曾經搞殘了蝙蝠俠的招數並沒有起作用，超人站起來冷笑一聲：「雖然沒了超能力，我畢竟還是個氪星人！」他用一連串組合拳將貝恩K翻在地。屋裡的蝙蝠俠也順利搞定稻草人，奪得了疫苗抗體。

與此同時，在城市的另一邊，負傷的美國隊長終於找到了火箭發射基地，他默默向自己暗示：愛就是克制，愛就是克制……與守衛在此的冬兵一番惡戰，終於將後者克制，並制止了火箭發射。得知這一消息，神盾局長尼克•弗瑞不再顧忌，派出戰鬥機向世貿雙塔發起攻擊。在雙塔轟然倒塌前，蝙蝠俠駕駛著飛行器，載著超人和毒藤女安然離開。

數日後，尼克•弗瑞假惺惺登台演講，把雙塔倒塌也歸為恐怖份子所為，並為那些在911蒙難的人們致哀。化身記者的超人望著雙塔中喪生的前女友拉娜•朗的相片，將眼淚嚥入腹中，儀式過後，他代表新聞界與尼克握手，忍住了將後者手骨捏碎的衝動。

影片最後一幕是超人佇立在城市的陰暗角落，蝙蝠俠從天而降：克拉克，你還好嗎。超人搖頭：我永遠不會原諒他們，這樣一來組建《正義聯盟》的計劃又要延後了，但我有個主意，《超人大戰蝙蝠俠》，可以在2016年完成。蝙蝠俠一陣驚訝：還叫《黎明升起》？不，超人堅定地說，叫《正義黎明》。兩人相視一笑，超人戴上了眼鏡，蝙蝠俠摘掉了面具，並肩融進紐約城熙熙攘攘的人流中，留下一雙偉岸的背影。（文/方聿南）